Национальная водная информационная система создана в целях сбора, хранения, обработки и выдачи информации для информационного обеспечения разработки государственной политики, прогнозов, концепций, стратегий и программ развития в области водных ресурсов, бассейновых планов, проектов и мероприятий, связанных с управлением, использованием и охраной водных ресурсов, стратегического и оперативного принятия решений и информирования общественности в области водных ресурсов.

Ведение национальной водной информационной системы осуществляется Министерством энергетики и водных ресурсов Республики Таджикистан.

Национальная водная информационная система состоит из информационных систем «Государственный водный кадастр», «Геопортал», «Водохозяйственные балансы водных объектов», «Питьевое водоснабжение и водоотведение» и «Мелиорация и ирригация».